3-(Morpholin-2-yl)phenylboronic acid ถูกนำมาใช้หลักๆ ในเคมีอินทรีย์สังเคราะห์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร กลุ่ม boronic acid ของมันช่วยให้เกิดการ coupling ที่มีประสิทธิภาพกับ aryl halides ส่งเสริมการเกิดพันธะคาร์บอน-คาร์บอน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพและวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยคุณสมบัติโครงสร้างช่วยในการออกแบบโพลิเมอร์ขั้นสูงและตัวเร่งปฏิกิริยา การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงเคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการสังเคราะห์ยาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ เนื่องจากมีความเสถียรและสามารถทำปฏิกิริยาได้ดีกับสารตั้งต้นหลากหลายชนิด