กรด 3,5-บิส(ไตรฟลูออโรเมทิล)ฟีนิลโบรอนิก ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิงแบบซูซูกิ-มิยาอูระ ปฏิกิริยานี้จำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตยา สารเคมีทางการเกษตร และวัสดุขั้นสูง กลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลของสารนี้ช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความเสถียร ทำให้ทำหน้าที่เป็นคู่ปฏิกิริยาที่มีประสิทธิภาพในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่มีฐานเป็นบอรอน และเป็นหน่วยย่อยก่อสร้างในเคมียารักษาโรคสำหรับสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้มีประโยชน์ในการเตรียมสารเคมีพิเศษและโพลิเมอร์