กรดบอโรนิก 3,5-ไดฟลูออโรเฟนิล ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอสคัปเปลิง Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ช่วยให้สามารถสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยา พันธุ์กำจัดศัตรูพืชเคมี และวัสดุขั้นสูง กลุ่มบอโรนิกของมันทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญ อำนวยความสะดวกในการคัปเปลิง aryl หรือ vinyl halides กับ aryl boronic acids นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและผู้สมัครยา ซึ่งส่วน difluorophenyl สามารถเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเข้มข้นในการจับคู่ บทบาทของมันในวิทยาศาสตร์วัสดุรวมถึงการสร้างส่วนประกอบอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และโพลิเมอร์ที่มีคุณสมบัติเฉพาะที่ปรับแต่งได้ เนื่องจากคุณสมบัติที่เสถียรและสามารถทำปฏิกิริยาได้ดีกับสารตั้งต้นอื่น ๆ