(3,5-Difluoro-2-methoxyphenyl)boronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนได้ สารนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งมีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี่ ช่วยให้สามารถควบคุมปฏิกิริยาและความเลือกเฉพาะได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูง เช่น เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และโพลิเมอร์ โดยซึ่งกลุ่มกรดโบรอนิกช่วยอำนวยในการสร้างพันธะโคเวเลนต์ที่เสถียรกับกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ ทำให้เป็นสารเคมีที่มีคุณค่าต่อการออกแบบและผลิตวัสดุใหม่ที่มีคุณสมบัติเฉพาะเจาะจง