(3,4-difluoro-5-methoxyphenyl)boronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม Suzuki-Miyaura ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการผลิตยา พันธุ์พืชเคมี และวัสดุขั้นสูง สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันบอโรนิกแอซิด ซึ่งช่วยให้การจับคู่ที่มีประสิทธิภาพกับอะรีลฮาไลด์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาสารชีวภาพและการสังเคราะห์วัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ซึ่งต้องการโครงสร้างโมเลกุลที่แม่นยำ ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นตัวเลือกที่นิยมในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ทางอุตสาหกรรมต่างๆ