3,4,5-Trifluorophenylboronic acid ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่จำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้สามารถสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยา พีเอไอ (APIs) สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง กลุ่ม trifluorophenyl ของสารนี้ช่วยเพิ่มการตอบสนองทางเคมีและความเสถียรของ boronic acid ทำให้เป็น reagent ที่มีคุณค่าสำคัญในเคมียารักษาโรคสำหรับการค้นพบและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบฟลูออรีน ซึ่งมักใช้ในการผลิต active pharmaceutical ingredients (APIs) เนื่องจากคุณสมบัติพิเศษ เช่น ความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่เพิ่มขึ้นและ bioavailability ที่ดีขึ้น สารนี้ยังมีประโยชน์ในอุตสาหกรรมยา เนื่องจากใช้ในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพและตัวยาชนิดใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาวัสดุใหม่ๆ เช่น โพลีเมอร์หรือวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ ที่ต้องการโครงสร้างโมเลกุลเฉพาะที่มีฟลูออรีนเป็นส่วนประกอบ