2-(Methylthio)phenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลอินทรีย์ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งหมู่ boronic acid และ methylthio group ทำให้มีศักยภาพในการออกแบบโมเลกุลที่มีความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการสังเคราะห์วัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น โพลีเมอร์หรือวัสดุนาโน ในอุตสาหกรรมเคมีและเภสัชกรรม