2-Methoxy-3-pyridineboronic acid นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาเคมีประเภท cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติกหรือเฮเทอโรอะโรมาติกกับสารประกอบอื่น ๆ ด้วยความช่วยเหลือของตัวเร่งปฏิกิริยาพาลลาเดียม สารนี้มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ และวัสดุประเภทต่าง ๆ นอกจากนี้ ยังสามารถนำไปใช้ในการศึกษาวิจัยทางเคมีอินทรีย์เพื่อพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ ๆ ที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น