5-Fluoro-2-methoxypyridine-4-boronic acid เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอริลหรือวินิลโบโรนิกแอซิดกับอริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารกำจัดศัตรูพืช และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ ยังสามารถนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพได้