2-Chloro-4-methylpyridine-5-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบโรนิกแอซิดกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักนำไปใช้ในการผลิตยาและสารเคมีที่มีความซับซ้อน เช่น สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหรือตัวกลางในการสังเคราะห์โมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาวัสดุใหม่ๆ เช่น โพลิเมอร์หรือวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ที่มีคุณสมบัติเฉพาะตัว