2-Chloro-4-fluorophenylboronic acid ใช้อย่างแพร่หลายในการทำปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามของ Suzuki-Miyaura เพื่อสังเคราะห์สารประกอบไบอาริล ซึ่งมีความสำคัญในเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ และสารเคมีละเอียด ความสามารถในการก่อตัวเอสเตอร์โบโรเนตที่เสถียรทำให้มีคุณค่าการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาวัสดุสำหรับอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และโพลิเมอร์ขั้นสูง