2,4-Dimethoxyphenylboronic acid นิยมใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง (cross-coupling reaction) ที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนและสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมและสารเคมีชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่เมทอกซีช่วยเพิ่มความสามารถในการเกิดปฏิกิริยาและความเสถียร นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาวัสดุใหม่ๆ เช่น โพลิเมอร์ คริสตัลเหลว หรือวัสดุนาโน ที่ต้องการคุณสมบัติเฉพาะทางเคมีและฟิสิกส์