2,4-Difluorophenylboronic acid ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีและยา เนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการทำปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติกและสารประกอบโบรอนิก แอซิด นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาต้านเชื้อแบคทีเรียและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ ในด้านวัสดุศาสตร์ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และวัสดุเชิงฟังก์ชันที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น การนำไฟฟ้าหรือการเรืองแสง ซึ่งมีประโยชน์ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และเซ็นเซอร์ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในเคมีวิเคราะห์เพื่อเป็นรีเอเจนต์ในการตรวจวัดหรือแยกสารเฉพาะเจาะจงในตัวอย่างทางชีวภาพหรือสิ่งแวดล้อม