2,3-Difluorophenylboronic acid ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าในการผลิตยา สารเคมีทางการเกษตร และวัสดุขั้นสูง สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงสารประกอบชีวภาพและโพลิเมอร์ กลุ่ม boronic acid ของมันช่วยอำนวยการ coupling กับ aryl halides หรือ vinyl halides ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์และตัวเร่งปฏิกิริยา เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับ diols และกลุ่มฟังก์ชันอื่นๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการวิจัยและพัฒนาในเคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการออกแบบและสังเคราะห์ผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ