สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และเคมียา เพื่อเป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ กลุ่มบอโรนิกแอซิดทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาครอส-คัปปลิงแบบซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ การมีโมเลกุลพิเปอร์าซีนช่วยเพิ่มความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการออกแบบสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลางหรือการบำบัดมะเร็ง นักวิจัยมักใช้สารนี้ในการพัฒนายับยั้งหรือปรับตัวขนาดเล็กสำหรับเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยใช้คุณสมบัติโครงสร้างเพื่อเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเลือก นอกจากนี้ ตัวแทนคลอโรและเอทอกซี่ยังช่วยเพิ่มความยืดหยุ่นในการปรับเปลี่ยนทางเคมี ทำให้สามารถสร้างอนุพันธ์ที่หลากหลายสำหรับการประเมินทางชีวภาพ