3-Ethoxy-5-trifluoromethylphenylboronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยา มีคุณค่าอย่างยิ่งในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการพัฒนาโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ นอกจากนี้ กลุ่ม trifluoromethyl ช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบที่ได้ ทำให้เป็นตัวเลือกที่นิยมในเคมียารักษาโรค กลุ่ม ethoxy ยังช่วยเพิ่ม reactivity และ solubility ของสารประกอบ สนับสนุนการใช้ในกระบวนการทางเคมีหลากหลาย โดยรวมแล้ว มีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพและวัสดุขั้นสูง