ใช้ (2-Methylpyrimidin-5-yl)boronic acid ในการสังเคราะห์สารเคมีที่เป็นส่วนประกอบสำคัญในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในกระบวนการ Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนิกกับสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างไพริมิดีนที่มีความสำคัญทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารตัวกลางที่ใช้ในกระบวนการผลิตยาชนิดใหม่