(2-(3-Fluoropropoxy)phenyl)boronic acid ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอส-คัปพลิง เช่น Suzuki-Miyaura coupling ปฏิกิริยานี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยเภสัชกรรมเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งช่วยให้สามารถพัฒนาผู้สมัครยาได้ กลุ่ม fluoropropoxy ของสารนี้ช่วยเพิ่มความละลายและปฏิกิริยา ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบสารประกอบชีวภาพที่มีฤทธิ์ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในสาขาวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโพลิเมอร์ขั้นสูงและวัสดุฟังก์ชันนัล หน่วย boronic acid ช่วยให้สามารถจับติดกับไดออลได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีประโยชน์ในการพัฒนาเซ็นเซอร์และการศึกษาการจดจำคาร์โบไฮเดรต