2,4,5-Trifluorophenylboronic Acid ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในกระบวนการ cross-coupling reactions เช่น Suzuki-Miyaura reaction ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบ aryl หรือ vinyl halides กับ boronic acids ทำให้ได้สารประกอบที่มีความซับซ้อนและหลากหลายมากขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพเนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนซึ่งมักเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของยา