เมทิล 4-โบโรโน-3-คลอโรเบนโซเอท ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนต่างๆ หมู่โบรอนิกแอซิดทำให้เป็นสารเคมีที่มีคุณค่าต่อปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนสำหรับการพัฒนายา นอกจากนี้ สารนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและวัสดุขั้นสูง โดยคุณสมบัติโครงสร้างช่วยในการออกแบบโมเลกุลที่มีหน้าที่เฉพาะ การมีทั้งหมู่โบรอนิกแอซิดและคลอโรช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติม สร้างสถาปัตยกรรมเคมีที่หลากหลาย