2-aminopyrimidin-5-yl-5-boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบฮาโลเจน ช่วยในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยาและสารชีวโมเลกุล นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาเนื่องจากโครงสร้างที่สามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการออกแบบและพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ อีกทั้งยังเป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการศึกษาวิจัยทางเคมีเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์อีกด้วย