2-Fluoro-6-methoxyphenylboronic acid เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นปฏิกิริยาคู่ควบที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะริลโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอะริลฮาไลด์หรือไวนิลฮาไลด์ สารนี้มักใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารกำจัดศัตรูพืช และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการศึกษาทางเคมีเพื่อพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงและเป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม