2-Fluoro-4-(trifluoromethyl)phenylboronic acid นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในปฏิกิริยาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง เช่น Suzuki-Miyaura coupling เพื่อสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน มีคุณค่าต่อการวิจัยเภสัชภัณฑ์ในการพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับออกแบบโพลิเมอร์ขั้นสูงและวัสดุฟังก์ชันนัล โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้เหมาะสมสำหรับการประยุกต์ใช้ในสารเคมีเกษตร ช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ผลึกเหลวและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาเทคโนโลยีหน้าจอและอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งฟลูออรีนและกลุ่มไตรฟลูออโรเมทิล ซึ่งมักให้คุณสมบัติทางเคมีเฉพาะและความเสถียรที่เพิ่มขึ้น