(2-Fluoro-3-iodophenyl)boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลแฮไลด์ สารนี้ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งฟลูออรีนและไอโอดีนช่วยเพิ่มความหลากหลายในการออกแบบโมเลกุล นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในกระบวนการผลิตวัสดุอิเล็กทรอนิกส์และสารเรืองแสงอีกด้วย