2-Fluoro-4-methylpyridine-5-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นปฏิกิริยาคูpling ระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน สารนี้มีบทบาทในการผลิตสารเคมีที่มีความซับซ้อน เช่น ยา เคมีภัณฑ์ทางการเกษตร และวัสดุพิเศษ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการใช้งานทางเภสัชกรรมและอุตสาหกรรม