2-Fluoro-3-methoxyphenylboronic acid ถูกใช้อย่างแพร่หลายในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามของ Suzuki-Miyaura เพื่อสังเคราะห์สารประกอบ biaryl ที่ซับซ้อน ซึ่งมีความสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับสร้างวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ขั้นสูง เช่น OLEDs และเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ เนื่องจากความสามารถในการนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในโครงสร้างโมเลกุล กลุ่ม boronic acid ที่ไม่เหมือนใครยังทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาเซ็นเซอร์สำหรับตรวจจับน้ำตาลและชีวโมเลกุลอื่นๆ