2-Ethoxypyrimidine-5-boronic acid เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบ aryl หรือ vinyl boronic acid กับ aryl หรือ vinyl halides สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมและวัสดุศาสตร์ นอกจากนี้ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีเกษตร และสารประกอบที่มีความสำคัญทางอุตสาหกรรมอื่น ๆ