(3-(Difluoromethyl)phenyl)boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบต่างๆ ในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในกระบวนการ Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะริลโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอะริลฮาไลด์ หรืออะริลทรีฟเลต กลุ่ม difluoromethyl ช่วยเพิ่มความเสถียร ลิโพฟิลิก และฤทธิ์ทางชีวภาพของสารประกอบเป้าหมาย นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาต้านไวรัส และยาต้านจุลชีพ รวมถึงในอุตสาหกรรมวัสดุศาสตร์สำหรับการออกแบบโพลิเมอร์ขั้นสูงและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการสังเคราะห์สารป้องกันพืช และกลุ่มโบรอนิกแอซิดช่วยให้เกิดการจับติดแบบเลือกสรรกับไดออล ทำให้มีประโยชน์ในการทดสอบทางชีวเคมีและการพัฒนาเซ็นเซอร์