ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการเชื่อมโยงคาร์บอน-คาร์บอน และคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิ (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างกรดบอโรนิกกับสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบสำคัญในการออกแบบโมเลกุลที่มีความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพได้