2-Fluoro-3-cyclopropylphenylboronic acid ใช้ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการผลิตยาและสารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน นอกจากนี้ยังสามารถใช้ในการพัฒนาสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านเชื้อจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้างของสารนี้มีความเฉพาะเจาะจงและสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของสารเป้าหมาย