6-Fluoro-5-trifluoromethylpyridine-3-boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในการทำปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอาริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มีความสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งฟลูออรีนและไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนาวัสดุใหม่ๆ ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์และวัสดุศาสตร์ เพื่อปรับปรุงคุณสมบัติทางกายภาพและเคมีของวัสดุเหล่านั้น