2-Fluoro-6-phenylpyridine-3-boronic Acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอาริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้จึงมีบทบาทสำคัญในการผลิตสารเคมีที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยา เครื่องสำอาง และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยา