(2-fluoro-4-morpholinophenyl)boronic acid มักถูกนำมาใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนิกแอซิดกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้มีประโยชน์ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน เช่น ยารักษาโรคหรือสารตั้งต้นในการผลิตวัสดุที่มีความเฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่ฟลูออรีนและมอร์โฟลีนซึ่งสามารถส่งผลต่อประสิทธิภาพและความเสถียรของสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ