5-Fluoropyridin-2-ylboronic acid ถูกใช้อย่างแพร่หลายในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นวิธีสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน สารนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่สำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาผู้สมัครยาและส่วนประกอบยาสำคัญที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา กลุ่มโบรอนิกแอซิดของมันช่วยให้สามารถจับคู่กับอาไรล์แฮไลด์ต่างๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ส่งเสริมการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการออกแบบวัสดุอินทรีย์ขั้นสูง เช่น โพลิเมอร์และผลึกเหลว เนื่องจากความสามารถในการนำเข้าส่วนย่อยของไพริดีนที่ถูกฟลูออรีน การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยด้านเกษตรเคมี ซึ่งช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ โดยอำนวยความสะดวกในการสร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลาย