B-(4-เมทิล-5-ไพรีมิดินิล)บอโรนิกแอซิด ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอสคัปเปลิง Suzuki-Miyaura ซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการก่อตัวพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้สามารถสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร กลุ่มบอโรนิกแอซิดของมันทำปฏิกิริยากับฮาไลด์อะริลหรือวินิลใน presence ของตัวเร่งปฏิกิริยาพัลลาเดียม ส่งเสริมการสร้างอนุพันธ์ไบอาริลหรือสไตรีน สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารชีวภาพและวิทยาศาสตร์วัสดุ เนื่องจากความเสถียรและความสามารถในการทำปฏิกิริยา นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการเตรียมสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในกระบวนการค้นพบยาและเคมียารักษาโรค