สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งคินาสและตัวแทนบำบัดอื่นๆ ส่วนของกรดบอโรนิกช่วยให้สามารถใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งเป็นวิธีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการค้นพบยา นอกจากนี้ กลุ่มไพเพอราซีนช่วยเพิ่มศักยภาพในการออกแบบสารประกอบที่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น เช่น ความสามารถในการละลายและชีวเภสัชจลนศาสตร์ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษาการโต้ตอบของเอนไซม์และการพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายสำหรับโรค เช่น มะเร็งและการอักเสบ