3-Ethylfuran-2-boronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของสารประกอบ นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมวัสดุเพื่อสร้างโพลิเมอร์และสารประกอบที่มีคุณสมบัติพิเศษอีกด้วย