2-Chloro-6-(trifluoromethyl)phenylboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการเชื่อมโยงพันธะคาร์บอน-คาร์บอน (C-C) และคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม (C-X) ผ่านปฏิกิริยาคุปปลิง (Coupling Reactions) เช่น Suzuki-Miyaura Coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่นิยมใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับยารักษาโรค นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนาวัสดุใหม่ ๆ เช่น โพลีเมอร์และสารประกอบอินทรีย์ที่มีคุณสมบัติเฉพาะทางสำหรับการใช้งานในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และโฟโตโวลตาอิกส์