สารเคมีนี้ 2-(Tert-butoxymethyl)-5-fluorophenylboronic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา cross-coupling เช่น Suzuki-Miyaura reaction ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน เพื่อประกอบโมเลกุลซับซ้อน รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร หมู่ฟลูออโรฟีนิลช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความจำเพาะเจาะจง ในขณะที่หมู่ tert-butoxymethyl ที่ตำแหน่งออร์โธให้การป้องกันแบบ steric และปรับปรุงความละลาย ทำให้มีคุณค่าในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาวัสดุสำหรับอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และ optoelectronic เนื่องจากคุณสมบัติโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์