ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ หน้าที่ของกรดบอรอนิกช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม Suzuki-Miyaura ซึ่งช่วยให้เกิดการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนอย่างมีประสิทธิภาพในโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาตัวสมัครที่ขัดต่อโรคอักเสบ มะเร็ง และความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง การมีกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี่ช่วยเพิ่มความเลือกในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในส่วนประกอบที่ใช้งานสุดท้าย ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์เพื่อการปรับปรุงตัวนำเนื่องจากปฏิกิริยาที่เอื้ออำนวยและคุณสมบัติโครงสร้าง