2-Methoxyquinoline-3-boronic acid ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและมะเร็ง กลุ่มโบรอนิกแอซิดของมันช่วยอำนวยความสะดวกในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนที่มีคุณสมบัติทางรักษาได้ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการผลิตสีย้อมเรืองแสงและเซ็นเซอร์ ซึ่งใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและการวินิจฉัย โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ยังมีคุณค่าต่อวิทยาศาสตร์วัสดุในการออกแบบโพลิเมอร์และสารเคลือบขั้นสูง