1-Cyclohexenylboronic acid pinacol ester ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนและสารประกอบออร์กาโนฮาไลด์ ตัวนี้มักถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน เช่น ยา สารประกอบทางธรรมชาติ และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและการวิจัยทางเคมีเภสัชกรรม เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างได้ง่ายเพื่อให้ได้สารที่มีประสิทธิภาพและความเฉพาะเจาะจงสูง