2-Methoxypyridine-5-boronic acid pinacol ester ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนและสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ เช่น ยา สารตั้งต้นสำหรับวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ และสารเคมีสำหรับการวิจัย นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีชีวภาพ