สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น การจับคู่แบบ Suzuki-Miyaura กลุ่มเอสเตอร์โบรอนเนตของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักที่ช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการประกอบโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุขั้นสูง นอกจากนี้ โมเลกุลเบนโซอิมิดาโซลยังช่วยสนับสนุนการใช้ในการพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงยารักษาโรคที่กำหนดเป้าหมายไปยังโรคต่าง ๆ ความเสถียรและปฏิกิริยาของสารนี้ทำให้เป็นตัวกลางที่หลากหลายในการวิจัยเคมียารักษาและวิทยาศาสตร์วัสดุ