สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร กลุ่มฟังก์ชันเอสเตอร์บอโรนิกของมันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการทำปฏิกิริยาครอสคัปพลิงแบบซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างพทาลาซีนช่วยเพิ่มศักยภาพของมันในฐานะบล็อกก่อสร้างสำหรับสารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงตัวยับยั้งและตัวปรับของเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ หมู่แทนที่เทอร์ต-บิวทิลและฟลูออรีนยังช่วยเพิ่มความเสถียรและความเลือกสรรในการแปลงเคมีต่างๆ ทำให้เป็นตัวเรย์เอเจนต์ที่หลากหลายในการวิจัยเคมียารักษาโรค การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการสังเคราะห์ยารักษาโรคใหม่ที่มุ่งเป้าไปยังโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ