สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะปฏิกิริยาคัปปลิ้งข้ามแบบซูซูกิ-มิยาอูระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี กลุ่มโบรอนิกเอสเตอร์ช่วยให้เกิดการคัปปลิ้งที่มีประสิทธิภาพกับอาริลหรือวินิลฮาไลด์ ส่งเสริมการก่อตัวพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายา สารเคมีละเอียด และวัสดุ นอกจากนี้ โครงสร้างแกนไพรีมีดีนมักถูกนำเข้าไปในสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านไวรัสหรือยาต้านมะเร็ง ซึ่งเพิ่มความสำคัญในงานวิจัยเคมียารักษาโรค