สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และเคมียาในฐานะอนุพันธ์กรดบอรอนิก โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่ม phenylboronic acid pinacol ester ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม Suzuki-Miyaura ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยาและสารเคมีเกษตร ส่วนของ methoxyphenyl urea สามารถมีส่วนช่วยในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์รีเซพเตอร์ โดยเฉพาะในการค้นพบยาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ฟังก์ชันบอรอนิกเอสเตอร์ของมันอาจถูกสำรวจในการพัฒนาเซ็นเซอร์หรือโพรบสำหรับตรวจจับโมเลกุลชีวภาพ โดยใช้ความชอบของกรดบอรอนิกต่อไดออลและน้ำตาล