สารนี้มักใช้ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิง เช่น Suzuki-Miyaura coupling ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน กลุ่มบอโรเนตเอสเตอร์ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน มักใช้ในงานวิจัยเภสัชกรรมและการพัฒนายา นอกจากนี้ยังเป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ช่วยในการสำรวจตัวแทนบำบัดใหม่ กลุ่มโมร์โฟลีนยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและ bioavailability ในการออกแบบยา