ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพและสารประกอบยาที่มีศักยภาพ หน้าที่ของเอสเตอร์โบรอนิกทำให้มีคุณค่าในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิงแบบซูซูกิ-มิยาวูระ ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน นิยมใช้ในเคมียารักษาเพื่อพัฒนายับยั้งโปรติเอสและการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมาย กลุ่มเมทอกซีช่วยเพิ่มความละลายและสามารถมีอิทธิพลต่อความสัมพันธ์ในการจับกับระบบชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบเซ็นเซอร์และวัสดุฟังก์ชันนัลเนื่องจากความสามารถในการมีส่วนร่วมในปฏิกิริยาคอเวเลนต์ที่ย้อนกลับได้