ใช้เป็นสารเคมีตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างฮาไลด์อาริลหรือไวนิลกับกรดบอโรนิก โปรไฟล์ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เหมาะสมสำหรับการสร้างสารประกอบไบอาริล ซึ่งเป็นโครงสร้างหลักที่พบบ่อยในยา สารเคมีเกษตร และวัสดุฟังก์ชันนัล ไอออน trifluoro(3-methylbenzyl)borate ให้อายุการเก็บรักษาที่ยาวนานขึ้นและลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์เมื่อเทียบกับกรดบอโรนิกแบบดั้งเดิม ซึ่งช่วยปรับปรุงผลผลิตและความเลือกในการจับคู่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการฟังก์ชันนัไลเซชันระยะหลังของโมเลกุลซับซ้อนที่ต้องการสภาวะปฏิกิริยาที่อ่อนโยน